MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycoplasma hyorhinis HUB-1 chromosome

Total Repeats: 25281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014448	GAA	2	6	15456	15461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372817
502	NC_014448	TTG	2	6	15477	15482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304372817
503	NC_014448	ATTA	2	8	15483	15490	50 %	50 %	0 %	0 %	304372817
504	NC_014448	T	6	6	15496	15501	0 %	100 %	0 %	0 %	304372817
505	NC_014448	CAA	2	6	15551	15556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304372817
506	NC_014448	TAA	2	6	15657	15662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372817
507	NC_014448	AAATAA	2	12	15681	15692	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	304372817
508	NC_014448	TTG	2	6	15719	15724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304372817
509	NC_014448	TCA	2	6	15727	15732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304372817
510	NC_014448	ATTTT	2	10	15733	15742	20 %	80 %	0 %	0 %	304372817
511	NC_014448	TAA	2	6	15747	15752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372817
512	NC_014448	TTGAA	2	10	15780	15789	40 %	40 %	20 %	0 %	304372817
513	NC_014448	GAA	2	6	15796	15801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372817
514	NC_014448	TGTT	2	8	15821	15828	0 %	75 %	25 %	0 %	304372817
515	NC_014448	TAA	2	6	15842	15847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372817
516	NC_014448	GCT	2	6	15862	15867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304372817
517	NC_014448	TTCA	2	8	15869	15876	25 %	50 %	0 %	25 %	304372817
518	NC_014448	TGT	2	6	15951	15956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304372817
519	NC_014448	AAT	2	6	15996	16001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372817
520	NC_014448	GAA	2	6	16053	16058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372817
521	NC_014448	AAC	2	6	16083	16088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304372817
522	NC_014448	AATTAA	2	12	16140	16151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372817
523	NC_014448	GTT	2	6	16208	16213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304372817
524	NC_014448	AGTT	2	8	16232	16239	25 %	50 %	25 %	0 %	304372817
525	NC_014448	TAAT	2	8	16256	16263	50 %	50 %	0 %	0 %	304372817
526	NC_014448	AAG	2	6	16292	16297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372817
527	NC_014448	ATT	2	6	16326	16331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372817
528	NC_014448	CTGA	2	8	16337	16344	25 %	25 %	25 %	25 %	304372817
529	NC_014448	A	7	7	16397	16403	100 %	0 %	0 %	0 %	304372817
530	NC_014448	AT	3	6	16426	16431	50 %	50 %	0 %	0 %	304372817
531	NC_014448	TTG	2	6	16438	16443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304372817
532	NC_014448	CTA	2	6	16468	16473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304372817
533	NC_014448	AAATA	2	10	16488	16497	80 %	20 %	0 %	0 %	304372817
534	NC_014448	TAAAA	2	10	16518	16527	80 %	20 %	0 %	0 %	304372817
535	NC_014448	CAA	2	6	16607	16612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304372817
536	NC_014448	A	7	7	16698	16704	100 %	0 %	0 %	0 %	304372817
537	NC_014448	TAC	2	6	16712	16717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304372817
538	NC_014448	A	6	6	16720	16725	100 %	0 %	0 %	0 %	304372817
539	NC_014448	TTG	2	6	16746	16751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365897170
540	NC_014448	CTT	2	6	16798	16803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365897170
541	NC_014448	TTC	2	6	16813	16818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365897170
542	NC_014448	ATTTT	2	10	16854	16863	20 %	80 %	0 %	0 %	365897170
543	NC_014448	CAA	2	6	16888	16893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365897170
544	NC_014448	AAT	2	6	17036	17041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365897170
545	NC_014448	CAT	2	6	17062	17067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365897170
546	NC_014448	TCA	2	6	17115	17120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365897170
547	NC_014448	TTTC	2	8	17130	17137	0 %	75 %	0 %	25 %	365897170
548	NC_014448	T	6	6	17162	17167	0 %	100 %	0 %	0 %	365897170
549	NC_014448	CT	3	6	17181	17186	0 %	50 %	0 %	50 %	365897170
550	NC_014448	A	7	7	17193	17199	100 %	0 %	0 %	0 %	365897170
551	NC_014448	TCT	2	6	17202	17207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365897170
552	NC_014448	T	6	6	17207	17212	0 %	100 %	0 %	0 %	365897170
553	NC_014448	AAT	2	6	17246	17251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_014448	T	6	6	17258	17263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_014448	T	6	6	17283	17288	0 %	100 %	0 %	0 %	304372819
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557	NC_014448	TAA	2	6	17327	17332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372819
558	NC_014448	T	6	6	17370	17375	0 %	100 %	0 %	0 %	304372819
559	NC_014448	T	6	6	17406	17411	0 %	100 %	0 %	0 %	304372819
560	NC_014448	T	6	6	17498	17503	0 %	100 %	0 %	0 %	304372819
561	NC_014448	CAA	2	6	17504	17509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304372819
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563	NC_014448	T	6	6	17550	17555	0 %	100 %	0 %	0 %	304372819
564	NC_014448	TTA	2	6	17593	17598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372819
565	NC_014448	TAA	2	6	17606	17611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372819
566	NC_014448	GAA	2	6	17614	17619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372819
567	NC_014448	A	7	7	17622	17628	100 %	0 %	0 %	0 %	304372819
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570	NC_014448	ATTT	2	8	17666	17673	25 %	75 %	0 %	0 %	304372819
571	NC_014448	TAA	3	9	17687	17695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372819
572	NC_014448	TTC	2	6	17703	17708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304372819
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575	NC_014448	TTC	2	6	17808	17813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304372819
576	NC_014448	TATTT	2	10	17829	17838	20 %	80 %	0 %	0 %	304372819
577	NC_014448	T	8	8	17836	17843	0 %	100 %	0 %	0 %	304372819
578	NC_014448	AGC	3	9	17862	17870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304372819
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581	NC_014448	T	7	7	17976	17982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_014448	TAT	2	6	18004	18009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_014448	A	6	6	18020	18025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_014448	A	8	8	18033	18040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_014448	A	7	7	18043	18049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_014448	ATTTTT	2	12	18059	18070	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_014448	A	6	6	18106	18111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_014448	A	6	6	18115	18120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_014448	A	17	17	18148	18164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_014448	T	8	8	18178	18185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_014448	AAAAC	2	10	18270	18279	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
592	NC_014448	TTA	2	6	18284	18289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_014448	T	6	6	18299	18304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_014448	CGCT	2	8	18332	18339	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
595	NC_014448	CATG	2	8	18352	18359	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
596	NC_014448	ACCTA	2	10	18410	18419	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
597	NC_014448	TTAT	2	8	18470	18477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_014448	ATG	2	6	18481	18486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_014448	TTAG	2	8	18538	18545	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
600	NC_014448	GAT	2	6	18572	18577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_014448	GCA	2	6	18645	18650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_014448	TTC	2	6	18711	18716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_014448	CTG	2	6	18727	18732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_014448	GAA	2	6	18741	18746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_014448	A	6	6	18745	18750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_014448	TTA	2	6	18784	18789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_014448	CAG	2	6	18813	18818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_014448	ATT	2	6	18854	18859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_014448	T	6	6	18880	18885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_014448	GAA	2	6	19004	19009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_014448	TA	3	6	19038	19043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_014448	GAT	2	6	19112	19117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_014448	TGG	2	6	19125	19130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_014448	AAT	2	6	19131	19136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_014448	AGT	2	6	19174	19179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_014448	TCT	2	6	19285	19290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_014448	GTC	2	6	19345	19350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_014448	TCGTG	2	10	19354	19363	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
619	NC_014448	TTAAG	2	10	19418	19427	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
620	NC_014448	AGG	2	6	19455	19460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_014448	GAC	2	6	19469	19474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_014448	ATC	2	6	19480	19485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_014448	AC	3	6	19507	19512	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
624	NC_014448	A	6	6	19567	19572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_014448	GCTAC	2	10	19643	19652	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
626	NC_014448	AC	3	6	19677	19682	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
627	NC_014448	TGA	2	6	19759	19764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_014448	CCT	2	6	19816	19821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_014448	TAT	2	6	19953	19958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_014448	T	6	6	19969	19974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_014448	TAAAT	2	10	19993	20002	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_014448	AAT	2	6	20054	20059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_014448	TAAG	2	8	20092	20099	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
634	NC_014448	TGG	2	6	20106	20111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
635	NC_014448	TGA	2	6	20239	20244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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